在水中的生物，尤其是藻類、菌類，由于其細小，人肉眼很難發現，但是他們一旦爆發對于水質的污染可是相當的嚴重，一旦形成危害不但處理起來事倍功半，而且會耗費大量的殺生劑與金錢；檢測水中的微小生物包括幾種方法：化學分析，黏泥測定，微生物監測，物理觀察，通常一種監測結果不能反映水中微生物的真實情況。
相比于其他三種觀測，較為常用的就是物理觀察，做好平時的檢查可以相當經濟的做法，下面就介紹幾種常用但是很實用的方法：
1、色：通常水設備 處理過的水，水色透明、清澈，能見度高，如果有微生物危害，水的顏色應該會變暗，能見度會降低。
2、味：通常的情況下，處理過的水沒有異味，如果有藻類污染，會有一種腥味 或者是一種臭味，如果有這種情況，那就要警惕了，通常這種情況已經很嚴重了。
3、觀察黏泥：在整個水設備系統中，配水池或者配水槽是黏泥最容易沉淀的地方，正常的情況下，我們應該能夠看清楚水下的各個出水口，當出現微生物危害的時候，我們會發現這些部位出現了黏泥或者菌團，嚴重的時候黏泥可能會堵住出水口，此時就說明生物危害已經非常的嚴重了。
4、觀察藻類：在水設備的內壁、支撐架桿上是藻類最容易生長的地方，對于這些地方應該經常地觀察是否出現了藻類，如果有，就應該馬上采取行動。
5、觀察掛片：在水設備中的腐蝕掛片如果是裝在透明的有機玻璃管里，觀察掛片可以了解水中微生物的動向，正常的情況下市不會出現黑色的黏泥或者菌團，但當微生物危害是，掛片上夜會布滿了藻類或者菌膠團。
